Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NRXN1Q9ULB1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NRXN1Q9ULB1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NRXN1Q9ULB1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
NRXN1Q9ULB1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NRXN1Q9ULB1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NRXN1Q9ULB1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NRXN1Q9ULB1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NRXN1Q9ULB1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NRXN1Q9ULB1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
NRXN1Q9ULB1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NRXN1Q9ULB1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NRXN1Q9ULB1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NRXN1Q9ULB1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NRXN1Q9ULB1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NRXN1Q9ULB1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NRXN1Q9ULB1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NRXN1Q9ULB1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NRXN1Q9ULB1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms