Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO4Q9UKT5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO4Q9UKT5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO4Q9UKT5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms