Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
MLH3Q9UHC1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
MLH3Q9UHC1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
MLH3Q9UHC1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
MLH3Q9UHC1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
MLH3Q9UHC1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
MLH3Q9UHC1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
MLH3Q9UHC1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
MLH3Q9UHC1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
MLH3Q9UHC1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
MLH3Q9UHC1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
MLH3Q9UHC1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
MLH3Q9UHC1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
MLH3Q9UHC1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
MLH3Q9UHC1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
MLH3Q9UHC1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
MLH3Q9UHC1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
MLH3Q9UHC1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
MLH3Q9UHC1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
MLH3Q9UHC1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
MLH3Q9UHC1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms