Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP2Q9UDT6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CLIP2Q9UDT6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLIP2Q9UDT6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CLIP2Q9UDT6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms