Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
POLKQ9UBT6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
POLKQ9UBT6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
POLKQ9UBT6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
POLKQ9UBT6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
POLKQ9UBT6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLKQ9UBT6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLKQ9UBT6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLKQ9UBT6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
POLKQ9UBT6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLKQ9UBT6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLKQ9UBT6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLKQ9UBT6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLKQ9UBT6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
POLKQ9UBT6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
POLKQ9UBT6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
POLKQ9UBT6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
POLKQ9UBT6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
POLKQ9UBT6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
POLKQ9UBT6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
POLKQ9UBT6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
POLKQ9UBT6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
POLKQ9UBT6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
POLKQ9UBT6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
POLKQ9UBT6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms