Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS5

GABBR1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR1Q9UBS5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GABBR1Q9UBS5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GABBR1Q9UBS5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GABBR1Q9UBS5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms