Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL13Q9P2N7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL13Q9P2N7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms