Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARHGAP28Q9P2N2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARHGAP28Q9P2N2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms