Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
RRBP1Q9P2E9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RRBP1Q9P2E9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RRBP1Q9P2E9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RRBP1Q9P2E9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RRBP1Q9P2E9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
RRBP1Q9P2E9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
RRBP1Q9P2E9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
RRBP1Q9P2E9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
RRBP1Q9P2E9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RRBP1Q9P2E9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RRBP1Q9P2E9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RRBP1Q9P2E9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.4 ms