Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL20A1Q9P218 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL20A1Q9P218 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL20A1Q9P218 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COL20A1Q9P218 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms