Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP1Q9P0U3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SENP1Q9P0U3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP1Q9P0U3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms