Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDUFA13Q9P0J0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFA13Q9P0J0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFA13Q9P0J0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms