Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBP1Q9NZI7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UBP1Q9NZI7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBP1Q9NZI7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBP1Q9NZI7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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