Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
MIS18AQ9NYP9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
MIS18AQ9NYP9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
MIS18AQ9NYP9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MIS18AQ9NYP9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MIS18AQ9NYP9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MIS18AQ9NYP9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MIS18AQ9NYP9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MIS18AQ9NYP9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
MIS18AQ9NYP9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
MIS18AQ9NYP9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MIS18AQ9NYP9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
MIS18AQ9NYP9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MIS18AQ9NYP9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MIS18AQ9NYP9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MIS18AQ9NYP9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
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