Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF38Q9NXL2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ARHGEF38Q9NXL2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF38Q9NXL2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms