Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC38A7Q9NVC3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC38A7Q9NVC3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC38A7Q9NVC3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC38A7Q9NVC3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC38A7Q9NVC3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC38A7Q9NVC3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC38A7Q9NVC3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC38A7Q9NVC3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC38A7Q9NVC3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms