Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX7

RNF146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF146Q9NTX7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF146Q9NTX7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF146Q9NTX7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF146Q9NTX7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF146Q9NTX7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF146Q9NTX7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF146Q9NTX7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF146Q9NTX7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF146Q9NTX7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF146Q9NTX7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF146Q9NTX7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF146Q9NTX7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF146Q9NTX7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF146Q9NTX7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF146Q9NTX7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF146Q9NTX7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms