Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EMILIN3Q9NT22 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EMILIN3Q9NT22 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
EMILIN3Q9NT22 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EMILIN3Q9NT22 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms