Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM7SF3Q9NS93 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM7SF3Q9NS93 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TM7SF3Q9NS93 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM7SF3Q9NS93 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms