Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
LTBP3Q9NS15 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LTBP3Q9NS15 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LTBP3Q9NS15 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LTBP3Q9NS15 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LTBP3Q9NS15 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LTBP3Q9NS15 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
LTBP3Q9NS15 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LTBP3Q9NS15 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LTBP3Q9NS15 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LTBP3Q9NS15 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LTBP3Q9NS15 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LTBP3Q9NS15 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LTBP3Q9NS15 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LTBP3Q9NS15 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LTBP3Q9NS15 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LTBP3Q9NS15 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
LTBP3Q9NS15 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LTBP3Q9NS15 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LTBP3Q9NS15 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms