Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ2

PLSCR4, Phospholipid scramblase 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLSCR4Q9NRQ2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLSCR4Q9NRQ2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLSCR4Q9NRQ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLSCR4Q9NRQ2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLSCR4Q9NRQ2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLSCR4Q9NRQ2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PLSCR4Q9NRQ2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLSCR4Q9NRQ2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLSCR4Q9NRQ2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PLSCR4Q9NRQ2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLSCR4Q9NRQ2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLSCR4Q9NRQ2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms