Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPTBN5Q9NRC6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTBN5Q9NRC6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTBN5Q9NRC6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTBN5Q9NRC6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTBN5Q9NRC6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTBN5Q9NRC6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTBN5Q9NRC6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTBN5Q9NRC6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPTBN5Q9NRC6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPTBN5Q9NRC6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPTBN5Q9NRC6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPTBN5Q9NRC6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPTBN5Q9NRC6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SPTBN5Q9NRC6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPTBN5Q9NRC6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPTBN5Q9NRC6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPTBN5Q9NRC6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SPTBN5Q9NRC6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPTBN5Q9NRC6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPTBN5Q9NRC6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPTBN5Q9NRC6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPTBN5Q9NRC6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPTBN5Q9NRC6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPTBN5Q9NRC6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTBN5Q9NRC6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTBN5Q9NRC6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPTBN5Q9NRC6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPTBN5Q9NRC6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPTBN5Q9NRC6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPTBN5Q9NRC6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTBN5Q9NRC6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTBN5Q9NRC6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTBN5Q9NRC6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTBN5Q9NRC6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPTBN5Q9NRC6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTBN5Q9NRC6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms