Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C8orf4Q9NR00 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf4Q9NR00 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf4Q9NR00 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms