Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX7

ITM2C, Integral membrane protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2CQ9NQX7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2CQ9NQX7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2CQ9NQX7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2CQ9NQX7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2CQ9NQX7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2CQ9NQX7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2CQ9NQX7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2CQ9NQX7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2CQ9NQX7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITM2CQ9NQX7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITM2CQ9NQX7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITM2CQ9NQX7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2CQ9NQX7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2CQ9NQX7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2CQ9NQX7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2CQ9NQX7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2CQ9NQX7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITM2CQ9NQX7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITM2CQ9NQX7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITM2CQ9NQX7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITM2CQ9NQX7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITM2CQ9NQX7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITM2CQ9NQX7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms