Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNMB3Q9NPA1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNMB3Q9NPA1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNMB3Q9NPA1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms