Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PNPLA8Q9NP80 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNPLA8Q9NP80 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNPLA8Q9NP80 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNPLA8Q9NP80 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms