Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM60AQ9NP50 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM60AQ9NP50 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM60AQ9NP50 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.4 ms