Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCQ5

GALNT9, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 9, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT9Q9HCQ5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
GALNT9Q9HCQ5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GALNT9Q9HCQ5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GALNT9Q9HCQ5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms