Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRPM3Q9HCF6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TRPM3Q9HCF6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRPM3Q9HCF6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRPM3Q9HCF6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRPM3Q9HCF6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRPM3Q9HCF6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRPM3Q9HCF6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRPM3Q9HCF6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRPM3Q9HCF6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRPM3Q9HCF6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRPM3Q9HCF6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRPM3Q9HCF6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRPM3Q9HCF6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRPM3Q9HCF6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRPM3Q9HCF6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRPM3Q9HCF6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRPM3Q9HCF6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRPM3Q9HCF6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRPM3Q9HCF6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRPM3Q9HCF6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRPM3Q9HCF6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRPM3Q9HCF6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRPM3Q9HCF6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRPM3Q9HCF6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms