Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ELL3Q9HB65 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ELL3Q9HB65 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms