Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.7■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CLSPNQ9HAW4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CLSPNQ9HAW4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CLSPNQ9HAW4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
CLSPNQ9HAW4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CLSPNQ9HAW4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
CLSPNQ9HAW4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CLSPNQ9HAW4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CLSPNQ9HAW4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CLSPNQ9HAW4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CLSPNQ9HAW4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CLSPNQ9HAW4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CLSPNQ9HAW4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLSPNQ9HAW4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CLSPNQ9HAW4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CLSPNQ9HAW4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CLSPNQ9HAW4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CLSPNQ9HAW4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CLSPNQ9HAW4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CLSPNQ9HAW4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms