Protein–RNA interactions for Protein: Q9H977

WDR54, WD repeat-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR54Q9H977 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR54Q9H977 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR54Q9H977 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR54Q9H977 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR54Q9H977 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR54Q9H977 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
WDR54Q9H977 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR54Q9H977 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR54Q9H977 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR54Q9H977 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms