Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCAS3Q9H6U6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCAS3Q9H6U6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BCAS3Q9H6U6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms