Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RETREG1Q9H6L5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RETREG1Q9H6L5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RETREG1Q9H6L5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RETREG1Q9H6L5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms