Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5V9

CXorf56, UPF0428 protein CXorf56, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf56Q9H5V9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CXorf56Q9H5V9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXorf56Q9H5V9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CXorf56Q9H5V9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXorf56Q9H5V9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms