Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4W6

EBF3, Transcription factor COE3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF3Q9H4W6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBF3Q9H4W6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EBF3Q9H4W6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EBF3Q9H4W6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms