Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX5Q9H2C1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX5Q9H2C1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LHX5Q9H2C1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LHX5Q9H2C1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms