Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMG9Q9H0W8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMG9Q9H0W8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG9Q9H0W8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
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