Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL4Q9C0H6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL4Q9C0H6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL4Q9C0H6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms