Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PUS3Q9BZE2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PUS3Q9BZE2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PUS3Q9BZE2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PUS3Q9BZE2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PUS3Q9BZE2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PUS3Q9BZE2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PUS3Q9BZE2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PUS3Q9BZE2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PUS3Q9BZE2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PUS3Q9BZE2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PUS3Q9BZE2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PUS3Q9BZE2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PUS3Q9BZE2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PUS3Q9BZE2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PUS3Q9BZE2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PUS3Q9BZE2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PUS3Q9BZE2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PUS3Q9BZE2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PUS3Q9BZE2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PUS3Q9BZE2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PUS3Q9BZE2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms