Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM62Q9BVG3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM62Q9BVG3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM62Q9BVG3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM62Q9BVG3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM62Q9BVG3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM62Q9BVG3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM62Q9BVG3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM62Q9BVG3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM62Q9BVG3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM62Q9BVG3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM62Q9BVG3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM62Q9BVG3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM62Q9BVG3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms