Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDC1Q9BTX1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDC1Q9BTX1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDC1Q9BTX1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms