Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SIKE1Q9BRV8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIKE1Q9BRV8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SIKE1Q9BRV8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms