Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RIOK1Q9BRS2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RIOK1Q9BRS2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RIOK1Q9BRS2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms