Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX50Q9BQ39 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX50Q9BQ39 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX50Q9BQ39 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX50Q9BQ39 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms