Protein–RNA interactions for Protein: Q99729

HNRNPAB, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPABQ99729 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HNRNPABQ99729 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HNRNPABQ99729 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HNRNPABQ99729 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HNRNPABQ99729 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms