Protein–RNA interactions for Protein: Q99729

HNRNPAB, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPABQ99729 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HNRNPABQ99729 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HNRNPABQ99729 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HNRNPABQ99729 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HNRNPABQ99729 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HNRNPABQ99729 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HNRNPABQ99729 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HNRNPABQ99729 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms