Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIGMAR1Q99720 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SIGMAR1Q99720 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIGMAR1Q99720 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms