Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1Q99536 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAT1Q99536 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VAT1Q99536 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms