Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EYA3Q99504 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EYA3Q99504 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
EYA3Q99504 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EYA3Q99504 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms