Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SIN3AQ96ST3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SIN3AQ96ST3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SIN3AQ96ST3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SIN3AQ96ST3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SIN3AQ96ST3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SIN3AQ96ST3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SIN3AQ96ST3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SIN3AQ96ST3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SIN3AQ96ST3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SIN3AQ96ST3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SIN3AQ96ST3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SIN3AQ96ST3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SIN3AQ96ST3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SIN3AQ96ST3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SIN3AQ96ST3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
SIN3AQ96ST3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SIN3AQ96ST3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SIN3AQ96ST3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SIN3AQ96ST3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SIN3AQ96ST3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SIN3AQ96ST3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SIN3AQ96ST3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SIN3AQ96ST3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SIN3AQ96ST3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SIN3AQ96ST3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SIN3AQ96ST3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SIN3AQ96ST3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SIN3AQ96ST3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SIN3AQ96ST3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SIN3AQ96ST3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SIN3AQ96ST3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SIN3AQ96ST3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SIN3AQ96ST3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms